Přejít k obsahu | Přejít k hlavnímu menu | Přejít k vyhledávání

Informace o projektu
Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik

Logo poskytovatele
Kód projektu
GP203/07/P471
Období řešení
1/2007 - 12/2009
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
  • Postdoktorské projekty
Fakulta / Pracoviště MU
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova
proteomová analýza, bakteriální adaptace, molekulární mechanismy, Paracoccus denitrificans

Podstatou projektu je zejména posouzení vlivu tří známých regulačních proteinů na proteom bakterie Paracoccus denitrificans v procesech adaptace na změny vnějšího prostředí. Je známo, že tyto proteiny působí jako senzory pro kyslík a dusíkaté terminální akceptory elektronů. Po vytvoření databáze k identifikaci proteinů na základě nedávno zpřístupněné genomové sekvence bakterie bude provedena podrobná proteomová studie, srovnávající vliv mutací genů pro regulační proteiny na expresi ostatních proteinů v celobuněných lyzátech. Proteiny budou separovány dvourozměrnou gelovou elektroforézou a identifikovány hmotností spektrometrií. Proteiny se změnami v expresi budou dále podrobeny bioinformatické analýze, u vybraných proteinů budou doplněny funkční analýzy (stanovení enzymových aktivit a hladin mRNA). Ke komplementárnímu srovnáni proteinového složení membránových frakcí bude vybrána a testována nová metoda na bázi kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Vytvořená dtabáze přeloženého genomu bude rovněž využita k identifikaci proteinů z dřívějších studií. Získané výsledky budou po publikaci použity k doplnění veřejné proteomové 2-D databáze P.denitrificans (http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE/).

Publikace

Počet publikací: 8

2011

2010

2009

2008

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.