Informace o projektu
Klonální expanze u chronické lymfocytární leukémie – (epi)genomická charakterizace pro lepší pochopení nemoci
- Kód projektu
- NW24-03-00052
- Období řešení
- 5/2024 - 12/2027
- Investor / Programový rámec / typ projektu
- Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Lékařská fakulta
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
Navrhovaný projekt si klade za cíl studovat příčiny rozvoje klonálních maligních lymfoproliferací. Detailně se zaměříme na chronickou lymfocytární leukémii (CLL) jako modelové onemocnění. CLL je obvykle charakteristická monoklonální expanzí B lymfocytů. Předpokládá se, že při jejím rozvoji hrají klíčovou úlohu antigenní stimuly. V naší předchozí práci jsme však popsali případy víceklonální CLL, kdy u jednoho pacienta došlo ke klonální expanzi více B lymfocytů. Tyto případy lze považovat za mezistupeň mezi premaligním stádiem monoklonální B lymfocytózy, která navzdory svému názvu může být víceklonální, a plně rozvinutou CLL. Na základě podrobné analýzy vlastností B buněčných receptorů koexistujících klonů jsme stanovili hypotézu, že k jejich konečné maligní transformaci dochází na určitých úrovních maturace B lymfocytu. V navrhovaném projektu využijeme technologie single-cell sekvenování transkriptomu a určení aktivity chromatinu, abychom identifikovali molekulární profily maturačních stádií B lymfocytů, na nichž k maligní transformaci došlo. Dále literatura dokládá, že k iniciálním změnám dochází už na úrovni kmenových buněk. Předpokládáme, že v takovém případě by koexistující klony sdílely alespoň několik společných mutací, které by klonům poskytovaly selekční výhodu. Využijeme proto sortování jednotlivých leukemických klonů a následné celoexomové sekvenování, abychom takové mutace identifikovali. Na závěr budeme studovat funkční dopady nalezených mutací.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 1
2024
-
VYUŽITÍ VYSOKOKAPACITNÍCH SEKVENAČNÍCH METOD PRO CHARAKTERIZACI GENOMICKÉ KOMPOZICE VÍCEKLONÁLNÍCH CHRONICKÝCH LYMFOCYTÁRNÍCH LEUKEMIÍ
Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty