Výsledkem separace bílkovin v kapalné fázi (LLPS) jsou kondenzáty, které hrají v buňce
klíčovou roli. LLPS často závisí na vnitřně neuspořádaných proteinech. O LLPS u bakterií je
známo velmi málo. Nedávno jsme pozorovali neočekávanou LLPS u částečně neuspořádaného
mykobakteriálního faktoru sigma (SigA, podjednotka RNAP) in vitro. To naznačuje, že bakterie
může využívat LLPS k organizaci svého transkripčního aparátu. Dále jsme identifikovali dosud
neznámý transkripční faktor (UCP7) ze stejné bakterie složený ze strukturovaných a neuspořádaných částí. Navrhujeme prozkoumat význam LLPS v bakteriální transkripci s využitím Mycobacterium smegmatis jako modelového systému. Popíšeme dynamiku proteinů
SigA a UCP7 a charakterizujeme jejich schopnost tvořit LLPS. Definujeme role jejich
nestrukturovaných částí v transkripci. Celkově pak projekt poskytne komplexní model fungování
nestrukturovaných částí bakteriálního transkripčního aparátu a odhalí, zda/jak LLPS ovlivňuje
expresi prokaryotických genů.