Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Evoluce genomu a časoprostorová diversita v tribu Arabideae

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GA15-18545S
Project Period
1/2015 - 12/2017
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology

Tribus Arabideae s více než 487 druhy je největším tribem čeledi Brassicaceae; mnohé druhy rodu Arabis a Draba jsou široce rozšířené a některé jsou pěstovány jako okrasné rostliny. Diversifikace do několika linií s rozdílnou fylogeografickou minulostí činí z tribu Arabideae skvělý systém pro analýzu evoluce genomu rostlin. V navrhovaném projektu budeme rekonstruovat evoluci genomu metodami srovnávací cytogenomiky a epigenetiky, a také pomocí sekvenování nové generace. U zástupců hlavních fylogenetických linií etablujeme strukturu současných i ancestrálních genomů a porovnáme je s diversitou DNA repetic. Zjištěné vzprce genomové organizace a variabilita analyzovaných repetic budou porovnány s několika intrinsickými a extrinsickými faktory. Rozsah a rychlost genomových změn bude konfrontována s fylogenetickým postavením, způsobem reprodukce (samo- vs. cizosprašnost), žvotní formou (jednoletky vs. trvalky), nadmořskou výškou (nižinné vs. horské druhy) a geografickým původem. Poprvé budou získány údaje o mechanismu a dynamice chromosomové reorganizace pro celý tribus cévnatých rostlin.

Publications

Total number of publications: 3

2021

2020

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.