Informace o projektu
Specifické iontové efekty pro proteiny v roztocích a podobné biologicky relevantní systémy
- Kód projektu
- GA203/08/0114
- Období řešení
- 1/2008 - 12/2012
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- ionty solí, enzymatické reakce, membrány, molekulová dynamika, fluorescenční spektroskopie
- Spolupracující organizace
-
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. Martin Hof, Dr.
- Odpovědná osoba Doc. Mgr. Pavel Jungwirth, CSc.
- Odpovědná osoba Doc. RNDr. Rüdiger Ettrich, Ph.D.
Mechanismus hydratace iontů a interakce iontů s biomolekulami hrají důležitou roli v mnoha přírodních a biotechnologických procesech. V rámci tohoto projektu plánujeme kombinovat výpočetní a experimentální nástroje s cílem dojít k základnímu porozumění těchto interakcí na molekulové úrovni. Soustředíme se na iontově specifické interakce s proteiny ve vodných a nevodných roztocích a na lipidových membránách. Pečlivě naplánované simulace molekulové dynamiky a expeerimenty nám vposledu dovolí formulovat obecná pravidla, řídící interakce biologicky relevantních iontů se solvatovanými proteiny a membránami, a racionalizovat iontové efekty na aktivitu enzymů.
Publikace
Počet publikací: 37
2011
-
Construction of pollutant-degrading bacteria by protein and metabolic engineering
Rok: 2011, druh: Vyžádané přednášky
-
Effects of Organic Co-Solvents on Enzyme Activity: In Silico Analysis
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Engineering Robust and Efficient Protein Catalysts
Rok: 2011, druh: Vyžádané přednášky
-
Medium and protein engineering for improvement of biocatalysis in non-conventional media
Rok: 2011, druh: Vyžádané přednášky
-
Molecular mechanisms of the effects of organic solvents on activity of haloalkane dehalogenases
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Molekulární podstata působení organických rozpouštědel na strukturu a funkci haloalkandehalogenáz
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The Effect of pH and Temperature.
FEBS Journal, rok: 2011, ročník: 278, vydání: 15, DOI
-
Substrate Specificity of Haloalkane Dehalogenases
Biochemical Journal, rok: 2011, ročník: 435, vydání: 435, DOI
2010
-
Biochemical and structural characterization of novel haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkani USDA94 possesing two halide binding sites
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Early Warning Biosensors for Detection of Chemical Warfare Agents.
CHEMICKE LISTY, rok: 2010, ročník: 104, vydání: 104