Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Project Identification
- NR8967
- Project Period
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Agriculture R&D Programme
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Responsible person MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publications
Total number of publications: 90
2009
-
Macrolide treatment failure in a case of secondary syphilis: a novel A2059G mutation in the 23S rRNA gene of Treponema pallidum subsp. pallidum.
Journal of Medical Microbiology, year: 2009, volume: 58, edition: 6
-
Mapování sekvenčních rozdílů u rodu Treponema.
XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů., year: 2009
-
Molekulárně biologická diagnostika původce syfilis Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu.
Year: 2009, type: Conference abstract
-
Molekulární detekce lokusu makrolidové rezistence u klinických izolátů syfilis v České republice.
Year: 2009, type: Conference abstract
-
Nová strategie sekvencování celého genomu patogenních spirochet.
XIII.Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2009
-
Přínos PCR pro diagnostiku časné syfilidy.
Year: 2009, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Rezistence T. pallidum k makrolidům (diagnostika a kazustika).
Year: 2009, type: Conference abstract
-
Screening of macrolide resistance locus in Treponema pallidum subsp. pallidum in the Czech Republic.
Clinical Microbiology and Infection, Abstracts of the 19th ECCMID, P698, year: 2009
-
Srovnání genomů původců yaws s genomem kmene Nichols, původcem syfilis.
XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2009
-
Syfilis, diagnostika a kmenová typizace.
Year: 2009, type: Conference abstract