Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Faculty of Medicine. Official project website can be found on muni.cz.

Project Identification

NR8967

Project Period

1/2006 - 12/2009

Investor / Pogramme / Project type

Ministry of Health of the CR

Ministry of Agriculture R&D Programme

MU Faculty or unit

Faculty of Medicine

Cooperating Organization

St. Anne's University Hospital Brno

Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
Responsible person MUDr. Jana Račovská

Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.

Publications

Total number of publications: 90

2008

Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.

STROUHAL Michal MIKALOVÁ Lenka MATĚJKOVÁ Petra ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2008, type: Conference abstract
Sekvenace genomu Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D: srovnání tří metod celogenomové sekvenace.

ZOBANÍKOVÁ Marie MATĚJKOVÁ Petra STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ŠMAJS David

Article in Proceedings

XII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2008
Sequencing and molecular typing of hypervariable loci in the Treponema pallidum genomes: characterizations of type strains and clinical isolates.

ŠMAJS David MATĚJKOVÁ Petra STROUHAL Michal WOZNICOVÁ Vladana WEINSTOCK George M.

Article in Proceedings

Clinical Microbiology and Infection, Volume 14, Issue s7, Abstracts of the 18th ECCMID, P1704, year: 2008
Spirocheta Treponema pallidum a její detekce v klinickém materiálu.

FLASAROVÁ Magdalena ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2008, type: Conference abstract
Srovnání tří celogenomových sekvenačních metod při sekvenaci genomu Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D

ZOBANÍKOVÁ Marie ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2008, type: Conference abstract
Srovnání typovacích systémů u Treponema pallidum.

MATĚJKOVÁ Petra STROUHAL Michal ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana

Article in Proceedings

XII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2008
Syfilis u pacientů označovaných jako "men having sex with men" - význam přímého průkazu metodou PCR

WOZNICOVÁ Vladana DASTYCHOVÁ Eliška ŠMAJS David MATĚJKOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena VALIŠOVÁ Zuzana

Article in Periodical

Dermatologie pro praxi, year: 2008, volume: 2, edition: 4
Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.

FLASAROVÁ Magdalena MATĚJKOVÁ Petra VALIŠOVÁ Zuzana ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana

Conference abstract

Year: 2008, type: Conference abstract

2007

Analýza sigma 54 závislých promotorových oblastí Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ Darina ŠMAJS David

Article in Proceedings

XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2007
Comparative genomics of closely related treponemal strains

STROUHAL Michal MATĚJKOVÁ Petra ŠMAJS David SODERGREN E. NORRIS S. J. WEINSTOCK G. M.

Article in Proceedings

In Abstract Book: 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases, INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS, year: 2007