Informace o projektu
Single cell analysis: a modern tool to study clonal evolution in high-risk patients with chronic lymphocytic leukemia (Single cell analysis of CLL cells)

Informace

Projekt nespadá pod Přírodovědeckou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

NU20-08-00314

Období řešení

5/2020 - 12/2023

Investor / Programový rámec / typ projektu

Ministerstvo zdravotnictví ČR

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
Podprogram 1 - standardní

Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.

Spolupracující organizace

Fakultní nemocnice Brno

Odpovědná osoba Mgr. Jana Kotašková, Ph.D.

The proposed project builds on continuous well established research of our team in the field of hematologic malignancies. In this study we would like to profound our knowledge and understanding the mechanisms underlying clonal evolution of chronic lymphocytic leukaemia (CLL) cells. We have already studied CLL using variety of bulk analysis moreover we have also succeeded in single cell analysis. We believe that true personalised medicine is based of detailed characterisation of malignant cells of each patient with the potential to detect the most aggressive clones. From this prospective, single cell analysis gives the best opportunity to fulfil this need. The aim of our study is to compare transcriptomes of thousands CLL cells from consecutively collected samples of patients with aggressive disease with the aim to define the properties of subclones responsible for disease refractoriness.

Cíle udržitelného rozvoje

Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.

Publikace

Počet publikací: 20

2024

Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients

NAVRKALOVÁ Veronika PLEVOVÁ Karla RADOVÁ Lenka PORC Jakub Paweł PÁL Karol MALČÍKOVÁ Jitka PAVLOVÁ Šárka DOUBEK Michael PANOVSKÁ Anna KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Článek v odborném periodiku

British journal of haematology, rok: 2024, ročník: 204, vydání: 1, DOI
IκBε deficiency accelerates disease development in chronic lymphocytic leukemia

BORDINI Jessica LENZI Chiara FRENQUELLI Michela MORABITO Alessia PSEFTOGAS Athanasios BELLONI Daniela MANSOURI Larry TSIOLAS George PEROTTA Eleonora RANGHETTI Pamela GANDINI Francesca GENOVA Francesca HAGERSTRAND Daniel GAVRIILIDIS Georgios KEISARIS Sofoklis PECHLIVANIS Nikolaos DAVI Frederic KAY Neil E LANGERAK Anton W POSPÍŠILOVÁ Šárka SCARFO Lydia MAKRIS Antonios PSOMOPOULOS Fotis E STAMATOPOULOS Kostas ROSENQUIST Richard CAMPANELLA Alessandro GHIA Paolo

Článek v odborném periodiku

Leukemia, rok: 2024, ročník: 38, vydání: 6, DOI
Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing

KURUCOVÁ Terézia RÉBLOVÁ Kamila JANOVSKÁ Pavlína PORC Jakub Paweł NAVRKALOVÁ Veronika PAVLOVÁ Šárka MALČÍKOVÁ Jitka PLEVOVÁ Karla TICHÝ Boris DOUBEK Michael BRYJA Vítězslav KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Článek v odborném periodiku

Molecular oncology, rok: 2024, ročník: 18, vydání: 10, DOI

2023

A web-based bioinformatic tool LYNX for targeted LYmphoid NeXt- generation sequencing data analysis and visualization for hematooncology.

REIGL Tomáš PORC Jakub Paweł NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub PÁL Karol STRÁNSKÁ Kamila KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka PLEVOVÁ Karla

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer´s disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development

VÁŇOVÁ Tereza SEDMÍK Jiří RAŠKA Jan AMRUZ ČERNÁ Kateřina TAUŠ Petr POSPÍŠILOVÁ Veronika NEZVEDOVÁ Markéta FEDOROVÁ Veronika KADÁKOVÁ Soňa KLÍMOVÁ Hana CAPANDOVÁ Michaela ORVISKÁ Petra FOJTÍK Petr BÁRTOVÁ Simona PLEVOVÁ Karla SPÁČIL Zdeněk HŘÍBKOVÁ Hana BOHAČIAKOVÁ Dáša

Článek v odborném periodiku

CELL REPORTS, rok: 2023, ročník: 42, vydání: 11, DOI
RNA sekvenovanie jednotlivých buniek umožňuje charakterizáciu a sledovanie zriedkavých CLL buniek s potenciálom navodiť refraktérne ochorenie.

KURUCOVÁ Terézia RÉBLOVÁ Kamila VALIŠOVÁ Martina PORC Jakub Paweł NAVRKALOVÁ Veronika ZÁVACKÁ Kristýna PLEVOVÁ Karla TICHÝ Boris DOUBEK Michael KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
Single-cell RNA-sequencing enables tracking and characterization of rare CLL cells with the potential to cause refractoriness.

KURUCOVÁ Terézia RÉBLOVÁ Kamila VALIŠOVÁ Martina PORC Jakub Paweł NAVRKALOVÁ Veronika PAVLOVÁ Šárka MALČÍKOVÁ Jitka PLEVOVÁ Karla TICHÝ Boris DOUBEK Michael KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
Subclonal architecture of chromosomes revealed by single-cell analysis of gene expression in a patient with clonal evolution of relapsing/refractory CLL.

KOTAŠKOVÁ Jana KURUCOVÁ Terézia RÉBLOVÁ Kamila ZÁVACKÁ Kristýna MAREČKOVÁ Andrea BOHÚNOVÁ Michaela NAVRKALOVÁ Veronika JAROŠOVÁ Marie DOUBEK Michael PLEVOVÁ Karla POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
Tracking CLL cells with aberrations in the TP53 gene using scRNA-seq in relapsed/refractory patients.

NAVRKALOVÁ Veronika KURUCOVÁ Terézia RÉBLOVÁ Kamila BOHÚNOVÁ Michaela PLEVOVÁ Karla DOUBEK Michael MALČÍKOVÁ Jitka PAVLOVÁ Šárka KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

2022

Cytogenetics in Chronic Lymphocytic Leukemia: ERIC Perspectives and Recommendations

BALIAKAS Panagiotis ESPINET Blanca MELLINK Clemens JAROŠOVÁ Marie ATHANASIADOU Anastasia GHIA Paolo KATER Arnon P OSCIER David HAFERLACH Claudia STAMATOPOULOS Kostas

Článek v odborném periodiku

HemaSphere, rok: 2022, ročník: 6, vydání: 4, DOI