Informace o projektu
Single cell analysis: a modern tool to study clonal evolution in high-risk patients with chronic lymphocytic leukemia
(Single cell analysis of CLL cells)
- Kód projektu
- NU20-08-00314
- Období řešení
- 5/2020 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
- Podprogram 1 - standardní
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
- Odpovědná osoba Mgr. Jana Kotašková, Ph.D.
The proposed project builds on continuous well established research of our team in the field of hematologic malignancies. In this study we would like to profound our knowledge and understanding the mechanisms underlying clonal evolution of chronic lymphocytic leukaemia (CLL) cells. We have already studied CLL using variety of bulk analysis moreover we have also succeeded in single cell analysis. We believe that true personalised medicine is based of detailed characterisation of malignant cells of each patient with the potential to detect the most aggressive clones. From this prospective, single cell analysis gives the best opportunity to fulfil this need. The aim of our study is to compare transcriptomes of thousands CLL cells from consecutively collected samples of patients with aggressive disease with the aim to define the properties of subclones responsible for disease refractoriness.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 20
2022
-
Gene expression analysis on single cell level uncovers the subclonal architecture of chromosomes in a leukemia patient with multiple chromosomal aberrations.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Interrogating the molecular heterogeneity of chronic lymphocytic leukemia through computational approaches.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Loss of heterozygosity in EIF3F gene leading to intellectual disability in two siblings.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Přínos a úskalí sekvenačních metod v diagnostice hematologických malignit.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Realita zapojení molekulárně biologických metod do diagnostiky a stratifikace lymfoproliferativních onemocnění.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Single-cell RNA sequencing analysis of T helper cell differentiation and heterogeneity
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, rok: 2022, ročník: 1869, vydání: 10, DOI
-
Současná role cytogenomiky v diagnostice a prognostické stratifikaci hematologických malignit.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Subclonal architectureof chromosomes revealed by single-cell analysis of gene expression in a patient with clonal evolution of relapsing/refractory CLL
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
2021
-
B cell developmental trajectory modeling – Using complex immunophenotype to identify pre-malignant CLL B cell subsets in peripheral blood of healthy donors.
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
Data mining of publicly available scRNA-seq datasets: application of machine learning to interrogate normal cellular counterparts of chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty